微生物包括细菌、藻类、真菌和病毒等。细菌的颗粒极小，一般球菌直径为0.5～1.0微米；杆菌宽1微米，长2微米，病毒则更小，目前发现的最大的是痘病毒直径约300纳米，最小的是圆环病毒直径17纳米。微生物污染对反渗透膜系统至少造成两方面的不良后果：第一，微生物的大量繁殖和代谢，产生大量的的胶体物质，致使膜被堵塞造成膜通量急剧下降；第二，将造成产水中的细菌总数的增加。反渗透膜的微生物污染对整个装置的长周期运行极为不利，因此要对反渗透膜的微生物污染高度重视。

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